Les infections urinaires pourraient être alimentées par E. coli présent dans l'approvisionnement en viande aux États-Unis : Shots

Allison Aubrey

Certaines infections des voies urinaires peuvent être causées par la bactérie E. coli d’origine alimentaire, selon des recherches. Getty Images/Westend61 masquer la légende

Certaines infections des voies urinaires peuvent être causées par la bactérie E. coli d’origine alimentaire, selon des recherches.

Si vous avez eu une infection des voies urinaires, vous êtes en bonne compagnie. Environ 60 % des femmes en développeront une au cours de leur vie. Les infections urinaires entraînent chaque année plus d’un million de visites aux urgences et plus de 2 milliards de dollars en frais médicaux.

Bon nombre de ces infections sont causées par des souches courantes de la bactérie E. coli avec lesquelles les humains vivent depuis des millénaires. Mais les chercheurs étudient désormais une source inquiétante à l’origine de certaines maladies : l’approvisionnement en viande.

Les infections urinaires rendent la miction douloureuse ou difficile et peuvent interférer avec les relations sexuelles, le sommeil et l'exercice. Parfois, ils peuvent provoquer de la fièvre ou des frissons. Mais comme ils peuvent être traités avec des antibiotiques, ils sont considérés plus comme une nuisance que comme un problème de santé publique. Cependant, récemment, la résistance multi-médicaments à certaines bactéries, y compris les souches d’E. coli, à l’origine des infections urinaires est devenue une préoccupation croissante.

Mais bon nombre des plus de 700 souches connues d’Escherichia coli sont inoffensives. Les auteurs d’une nouvelle étude ont donc entrepris de résoudre un mystère : quelles souches provoquent des infections et d’où viennent-elles ?

Ils avaient le pressentiment que le système d’élevage américain pourrait être un coupable probable.

Les animaux de ferme et les humains ont des souches de bactéries E. coli dans leurs intestins. Lorsque les animaux de ferme sont abattus, les bactéries présentes dans leurs intestins peuvent contaminer la viande crue, qui peut à son tour contaminer les surfaces de la cuisine pendant la cuisson.

Une équipe de chercheurs a passé un an à collecter des échantillons de viande crue à Flagstaff, en Arizona, pour découvrir s'il existe un chevauchement entre les souches d'E. coli présentes dans l'approvisionnement en viande et les souches qui peuvent rendre les gens malades.

"Nous avons échantillonné tout le poulet, la dinde et le porc de chaque épicerie de la ville deux fois par mois", explique Lance Price, professeur à la Milken School of Public Health de l'Université George Washington et codirecteur fondateur de l'Antibiotic Resistance Action Center.

Ils ont également collecté des échantillons d’urine du centre médical Flagstaff auprès de personnes hospitalisées pour des infections urinaires.

Dans leur étude, publiée dans la revue scientifique One Health, les chercheurs ont découvert qu'environ 8 % des infections urinaires à Flagstaff pouvaient être attribuées à des bactéries présentes dans la viande. À l’échelle nationale, ils estiment que jusqu’à 640 000 infections chaque année sont causées par des souches d’E. coli d’origine alimentaire provenant d’animaux.

"Notre étude fournit des preuves irréfutables que des souches dangereuses d'E. coli se propagent des animaux destinés à l'alimentation aux humains via l'approvisionnement alimentaire et rendent les gens malades", a déclaré Price.

Pour établir le lien, les chercheurs ont ramené les échantillons de viande et d'urine à leur laboratoire et les ont cultivés pour E. coli, explique le co-auteur Paul Keim, directeur exécutif du Pathogen and Microbiome Institute de la Northern Arizona University. Ils ont effectué un séquençage génomique pour inspecter l’ADN des microbes.

Cela les a aidés à identifier des segments d’ADN de bactéries spécifiques aux souches animales et d’autres spécifiques aux souches humaines. "Nous avons commencé à reconnaître que voici ces petits paquets d'ADN qui sont très fortement associés au poulet", explique Price. D’autres peuvent être fortement associés au porc et d’autres aux humains.

"L'analyse génomique nous a permis de faire correspondre un certain nombre de souches différentes", explique Keim.

Le degré de chevauchement entre les souches d'E. coli provenant de la viande et celles trouvées dans les échantillons provenant de patients atteints d'infections urinaires était frappant, explique Tim Johnson, professeur au Collège de médecine vétérinaire de l'Université du Minnesota qui étudie les maladies et la génomique des volailles.

"Quand j'ai vu les données pour la première fois, j'ai été assez impressionné par la connectivité", dit Johnson, bien qu'il affirme que l'étude ne parvient pas à prouver que les infections urinaires étaient causées par E.coli provenant de la viande. Il souligne les autres façons dont les bactéries peuvent contaminer les approvisionnements alimentaires. Par exemple, ils peuvent pénétrer dans l’eau d’irrigation et contaminer les cultures.